MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 1647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	T	6	6	61	66	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017499	ATTC	2	8	90	97	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017499	ATT	2	6	110	115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017499	TAA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017499	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017499	ACC	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017499	TAAT	2	8	1071	1078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017499	TTAA	2	8	1108	1115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017499	CAC	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017499	T	6	6	1138	1143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017499	CTAT	2	8	1158	1165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017499	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017499	T	7	7	1192	1198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017499	CAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017499	TG	3	6	1214	1219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017499	T	6	6	1231	1236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017499	GGAA	2	8	1239	1246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017499	TAA	2	6	2324	2329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017499	TAAT	2	8	2543	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017499	AAT	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017499	CACT	2	8	2696	2703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017499	AAG	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017499	TTGATC	2	12	2752	2763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017499	GTA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017499	A	7	7	3698	3704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017499	T	6	6	3705	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017499	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017499	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017499	AAT	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017499	CTA	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017499	CTA	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017499	CTAAG	2	10	4739	4748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017499	TCT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017499	ATA	2	6	4932	4937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017499	GA	3	6	4941	4946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017499	TTC	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017499	TGA	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017499	ATT	2	6	5011	5016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017499	GTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017499	AAT	2	6	5056	5061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017499	ATT	2	6	5068	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017499	ATT	3	9	5095	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017499	TCC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017499	TAA	2	6	5146	5151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017499	A	7	7	5150	5156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017499	ACA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017499	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017499	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017499	TTA	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017499	TA	4	8	5317	5324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017499	AT	3	6	5331	5336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017499	TAAT	2	8	5349	5356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017499	AT	3	6	5370	5375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017499	TAA	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017499	AGGT	2	8	5483	5490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017499	A	7	7	6335	6341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017499	AAAT	2	8	6349	6356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017499	TGA	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017499	ATA	2	6	6489	6494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017499	AAG	2	6	6516	6521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017499	TA	4	8	6708	6715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017499	AAT	2	6	6719	6724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017499	TA	3	6	6730	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017499	ATA	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017499	ACA	2	6	6761	6766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017499	TA	3	6	6769	6774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017499	TAA	2	6	6782	6787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017499	ATT	2	6	6793	6798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017499	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017499	ATTT	2	8	6912	6919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017499	GGA	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017499	CGC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017499	T	6	6	7031	7036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017499	CTATA	2	10	7063	7072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017499	GGT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017499	AACA	2	8	7101	7108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017499	ATTT	2	8	7212	7219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017499	AAT	3	9	7220	7228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017499	ATG	2	6	8344	8349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017499	TTA	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017499	ACT	2	6	8432	8437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017499	CGA	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017499	T	7	7	8479	8485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017499	AGT	2	6	8554	8559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017499	CAT	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017499	ATA	2	6	8691	8696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017499	TA	3	6	8709	8714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017499	TAT	2	6	8742	8747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017499	T	7	7	8751	8757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017499	AT	3	6	8782	8787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017499	ACATTA	2	12	8848	8859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017499	TTA	2	6	8915	8920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017499	TA	4	8	8919	8926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017499	AGC	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017499	AAT	2	6	11495	11500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017499	AT	3	6	11540	11545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017499	TA	4	8	11549	11556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017499	TA	3	6	11569	11574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017499	AT	3	6	11597	11602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017499	TATACA	2	12	11623	11634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017499	ATA	2	6	11692	11697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017499	AGA	2	6	11787	11792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017499	TAT	2	6	11841	11846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017499	GAA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017499	GAA	2	6	11866	11871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017499	T	7	7	11890	11896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017499	AAC	2	6	11927	11932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017499	A	6	6	11963	11968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017499	AAG	2	6	11997	12002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017499	GAA	3	9	12095	12103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017499	TGT	2	6	12226	12231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017499	T	7	7	12255	12261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017499	A	7	7	12264	12270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017499	ATT	2	6	12311	12316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017499	GAA	2	6	13229	13234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017499	ATT	2	6	13309	13314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017499	TAT	2	6	13328	13333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017499	TTTA	2	8	13362	13369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017499	TAT	2	6	14049	14054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017499	TA	3	6	14068	14073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017499	AT	3	6	14130	14135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017499	ATTT	2	8	14152	14159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017499	T	6	6	14157	14162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017499	TA	3	6	14170	14175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017499	CTAAG	2	10	14233	14242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017499	A	6	6	14251	14256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017499	AAAT	2	8	14300	14307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017499	GGT	2	6	14334	14339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017499	AATT	2	8	14340	14347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017499	AGC	2	6	14359	14364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017499	AGT	2	6	14365	14370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017499	AGA	2	6	14371	14376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017499	AT	3	6	15523	15528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017499	ATGT	2	8	15608	15615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017499	ATA	2	6	17303	17308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017499	CTT	2	6	17318	17323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017499	ATT	2	6	17334	17339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017499	TAG	2	6	17346	17351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017499	TTTA	2	8	17353	17360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017499	AAC	2	6	17367	17372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017499	AGTA	2	8	17377	17384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017499	A	6	6	17397	17402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017499	TTTA	2	8	17431	17438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017499	TGTAAA	2	12	17459	17470	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017499	AG	3	6	17473	17478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017499	TAT	2	6	17493	17498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017499	A	6	6	17508	17513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017499	A	6	6	17527	17532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017499	TAAC	2	8	17555	17562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017499	A	6	6	20315	20320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017499	GAA	2	6	20355	20360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017499	AAG	2	6	20407	20412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017499	GAT	2	6	20443	20448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017499	ATGC	2	8	20480	20487	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_017499	TGG	2	6	20494	20499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017499	AT	3	6	20502	20507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017499	AGG	2	6	20582	20587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017499	A	6	6	20588	20593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017499	AAG	2	6	20609	20614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017499	AGAA	2	8	21932	21939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017499	GA	3	6	21977	21982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017499	TGTAA	2	10	21987	21996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017499	CTG	2	6	22892	22897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017499	AAT	2	6	22917	22922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017499	A	6	6	23020	23025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017499	GTA	2	6	23051	23056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017499	TGGT	2	8	23077	23084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017499	AAC	2	6	23118	23123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_017499	AAAG	2	8	24914	24921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017499	CAC	2	6	24945	24950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_017499	AAG	2	6	24961	24966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017499	A	8	8	26169	26176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017499	AGGT	2	8	26187	26194	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017499	TAA	2	6	26203	26208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_017499	GTT	2	6	27287	27292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017499	AATT	2	8	27422	27429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017499	TA	3	6	27460	27465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017499	TTGAA	2	10	29444	29453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017499	AGA	2	6	29553	29558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017499	TAG	2	6	29655	29660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017499	GAAAG	2	10	29733	29742	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017499	ATA	2	6	29750	29755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017499	ATA	2	6	29862	29867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017499	AT	3	6	29869	29874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_017499	A	6	6	38603	38608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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